Tiếp theo và hết Ngày 3/3/1918 Nga ký hiệp định hòa bình với Đức(Hiệp định Brest).
Theo hiệp định
Brest ,ngoại trừ những tầu thuyền hạm đội Baltic đã rút ra khỏi Helsingfor trước đó.Những chiếc còn lại cần phải lưu giữ và giải giáp,có nghĩa là những chiếc tầu này là con mồi săn được của Đức. Ngày 6/3/1918 đã có cuộc họp khẩn cấp của hội đồng Sô-viết hạm đội Baltic(Cơ quan quyền lực cao nhất của hạm đội Baltic vừa được thành lập 3/3/1918). Hội đồng Sô-viết ra quyết định khẩn cấp di rời hạm đội khỏi
Helsingfors chuyển tới
Kronstadt.(Vào ngày 4/3 trước đó đã có quyết định di rời lữ đoàn thiết giáp hạm tới Kronstadt).
Chỉ huy chiến dịch di rời từ
Helsingfors tới Kronstadt là đại tá Hải quân
A.M. Schastny,Phó chỉ huy Đại tá Hải quân S.V.Zаrubаеv quyết định di rời toàn bộ tầu thuyền hiện đồn trú tại
Helsingfors tới
Kronstadt.
Ngày 3/4/1918 quân Đức cho lính dù đổ bộ xuống Gange(Hanko) đe dọa chiếm cảng
Helsingfors.Thật đáng tiếc tầu phá băng đến muộn lên 4 chiếc tầu ngầm (AG 11,AG 12,AG 15, AG16 ) và 1 tầu vận tải "Oland" đã không kịp rút ra. Tất cả thuộc nữ đoàn tầu ngầm số 4. Ngày 4/4 Sô-viết tối cao hạm đội Baltic đã ra quyết định cho phép phá hủy đội tầu ngầm do Anh sản xuất(E-1,E-8,E-9,C-19,C-26,C-27,C-35) bên ngoài lộ trình(Sveaborg lộ trình mà Hạm đội đang rút).
Chiến dịch di chuyển tầu bè từ
Helsingfors tới
Kronstadt của hạm đội Baltic diễn ra trong điều kiện vô cùng khẩn trương và cũng vô cùng khó khăn. Các tầu ngầm không có sưởi ấm. Thủy thủ tầu ngầm thường xuyên phải ra khỏi tầu dùng xà beeng phá băng. Rất may những chiếc tầu ngầm không bị thấm nước, không có 1 hư hại nào lớn,bởi những tảng băng kia rất có thể làm vỡ vỏ tầu và nước sẽ nhấn chìm tầu xuống đáy biển.Như vậy đã kết thúc chiến dịch di tản tầu thuyền của Hạm đội Baltic.
Chiến dịch được kéo dài từ 12/3 đến 22/4/1918. Tất cả có 233 tầu thuyền các loại đã di tản thành công tới Kronstadt, trong đó có 12 tầu ngầm. Chiến dịch di tản tầu bè của hạm đội Baltic qua băng tuyết là 1 sự kiện có một không hai trong lịch sử Hải quân Thế giới. Những chiếc tầu tham gia di tản về
Kronstadt,trong năm nội chiến đã tích cực tham gia ngăn chặn sự can thiệp của nước ngoài. Sau khi nội chiến kết thúc,số tầu thuyền này là cơ sở để phục hưng Hải quân Sô-viết. Chúng ta không quên cám ơn đại tá
Schastnomu Alexei Mikhailovich. 12 chiếc tầu ngầm đã thực hiện cuộc di chuyển qua băng tuyết chở về,trong số chúng có 7 chiếc cần phải đưa tới Petrograd sửa chữa . Ngày 20/4 sắc lệnh số 320 của cục Hàng hải qui định tầu ngầm trong lực lượng Hải quân Sô-viết cần treo cờ nền đỏ với chữ trắng
"P.C.Ф.С.Р"(Российская социалистическая федеративная советская республика- Nước Cộng hòa xã hội chủ nghĩa Nga thuộc Liên bang Sô-viết)

.Ngày 31/5/1918 sắc lệnh 327 qui định về sự hợp nhất, theo thứ tự các đơn vị tầu ngầm hạm đội Baltic cần được tổ chức biên chế lại thành 2 sư đoàn tầu ngầm:
Sư đoàn tầu ngầm dự phòng(Sư đoàn số 1):Gồm các tầu đang sửa chữa lâu dài: "Con sói", "Vepr", "Ersh", "Con lươn", "Cá hồi", "Kasatka", "Cá rô", "Con rắn", "Kyguar", "Cá chép đỏ", "Cá hồi chó" . Tổng số 11 chiếc đóng tại căn cứ nổi "Tosno " ,tầu vận tải "Khabarovsk" và tàu cứu hộ "Volkhov" cũng thuộc biên chế sư đoàn tầu ngầm số 1 do К.Л.Соболев chỉ huy.
Sư đoàn tầu ngầm vũ trang(Sư đoàn 2): "Con hổ", "Con báo", "Chòm sao Linh miêu", "Tur", "Panthera", "Báo Leopag", "Minoga","Makrel" tất cả gồm 8 chiếc đóng tại căn cứ nổi "Hoàng đế PERTER" và căn cứ "Chiến binh" do Y. Zubarev chỉ huy.
Ngày 31/5/1918 là ngày đánh dấu sự hợp nhất lực lượng tầu ngầm, tổng số có 19 chiếc tại
Kronstadt